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１２モンキーズ ＃１２［二］
放送予定なし
第１２話「パラドックス」…タイムトラベルの影響で瀕死の状態にあるコール。キャシーは彼を救うため、２０１５年のジョーンズの助けを借りてコールの父親を探し出す。彼の息子、すなわち２０１５年のジェームズの血液が必要だった彼女たちは、コールの父親にすべてを打ち明けるが…。
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１２モンキーズ ＃１１［二］
放送予定なし
第１１話「明かされる真実」…ラムゼを追い、１９８７年の東京に行ったコールは、ヒマラヤ山脈で見つかったオリジナルのウイルスが入った生体サンプルを買うリーランドを目撃する。リーランドがウィルスを手に入れるのを阻止しようとしたコールだったが、突如現れたラムゼがコールを阻む…。
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１２モンキーズ ＃１０［二］
放送予定なし
第１０話「守るべきもの」…ラムゼは家族を守るための保険として、スプリンターを使って過去に行く前に打つ注射を盗み出す。ラムゼは“娘たち”と呼ばれる謎の集団に会い、運命を変える出来事が起こると予言を受ける。一方、カサンドラはウイルスが作られた場所に近づいていくが…。
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１２モンキーズ ＃９［二］
放送予定なし
第９話「明日を信じて」…疫病が世界に広がっている２０１７年、コールはＣＤＣでワクチン開発に取り組むキャシーと再会する。一方、２０４３年ではジョーンズ博士がコアを手に入れるため、スピアヘッドのフォスター大佐の元を訪れる。博士はコアを譲ってもらえるようフォスター大佐を説得しようとするが、大佐はその願いを退ける…。
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１２モンキーズ ＃８［二］
放送予定なし
第８話「スピアヘッド」…コアが不安定になったことでスプリンターが作動せず、コールは２０４３年に戻れないでいた。ジョーンズ博士はスプリンターの部品調達のためラムゼとウィートリーをスピアヘッドに送り込む。スピアヘッドに到着したラムゼだったが、そこにはかつての恋人エレナが暮らしていた。そして、彼女には息子がいることを知る…。
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１２モンキーズ ＃６［二］
放送予定なし
第６話「もうひとつの未来」…コールが戻った未来は本来の時間軸とは違うパラレルワールドだった。そこでは“ウエスト７”が施設を支配し、キャシーは２０１５年に殺害されていた。キャシーを救うことが時間軸を元に戻す解決策と考えたコールは、危険を冒し２０１５年に戻ろうとするが…。
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１２モンキーズ ＃５［二］
放送予定なし
第５話「ナイトルーム」…コールとキャシーは遂に、人類滅亡の源となったウィルスが保管されているリーランドの秘密の研究室“ナイトルーム”にたどり着く。しかし、２人はそこで“青白い男”が率いる軍団と鉢合わせてしまう。そこには囚われたジェニファーの姿も。破壊すべきウィルスを目の前にし、コールはある決断をするが…。
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１２モンキーズ ＃４［二］
放送予定なし
第４話「アタリ」…コールが“ナイトルーム”の在り処を探す一方、２０４３年の世界に危険が迫る。人々を襲って生き残り、権力を振るっていたスカベンジャーの王ディーコンたちに施設が襲われる可能性が出てきたのだ。タイムマシンが破壊されれば、二度と過去を変えることができず、世界は滅びてしまう。コールとラムゼは敵の裏をかいて、施設を守ろうとするが…。
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１２モンキーズ ＃３［二］
放送予定なし
第３話「逃げた男」…コールは、真相を知ると思われる“ナイトルーム”から逃げた男を捜すため、２０１４年へと送られる。ハイチで当時ライリー博士と一緒に働いていたその男に、ウィルスの在り処を聞き出すためだった。しかし、その時代にいるライリー博士と出会うことで時間軸が崩壊する危険を回避するため、近づかない方法で捜索を始めるが…。
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１２モンキーズ ＃２［二］
放送予定なし
第２話「忍び寄る影」…首謀者と思われたリーランド・ゴインズを殺害しても未来を変えられなかったコールとライリーは、実行犯とみられる“１２モンキーズ”の調査を進める。そして、それには精神科病院にいたある患者が関係していたことを知る。彼女はリーランド社長の一人娘、ジェニファーだった。彼女の病室の壁には、猿の壁画がいくつも残されていて…。
